Després d'enfrontar-se a un drac, rescatar una princesa i salvar el regne dels seus sogres, Shrek s'ha convertit en un pare de família que en lloc d'aterrir vilatans es dedica a signar autògrafs. La seva plàcida vida canvia quan signa un pacte amb Rumpelstiltskin i es troba que el seu món ha canviat: els ogres són perseguits, ell i Fiona mai s'han conegut i Rumpelstiltskin és el rei. Shrek, acompanyat dels seus incondicionals amics, Ruc, i Gat amb botes, comença una nova aventura per recuperar el seu món i l'amor de la seva vida.